Автор: | Бойко | Ограничение времени: | 1 сек | |
Входной файл: | input.txt | Ограничение памяти: | 200 Мб | |
Выходной файл: | Стандартный выход |
Дана нуклеотидная последовательность РНК длины L. Требуется написать программу, моделирующую вторичную структуру РНК с помощью алгоритма Нуссинов (при обратном проходе последовательность возможных ходов по матрице не менять местами! См. стр. 13 из 4-й лекции
). Длина петель должна быть не менее 3 нуклеотидов, при ветвлении между шпильками должно быть не менее 2 нуклеотидов. Учитывать лишь Уотсон-Криковские пары G-C, A-T и обратные им.
Во входном файле содержится одна строка.
Выходной файл должен содержать число комплементарных пар нуклеотидов, образующих шпильки и саму структуру, где спаренные нуклеотиды обозначены знаком < или > , а неспаренные точками. Например последовательность GGGAAAATCC будет записана как . < < < ... > > > .
L < 100.
№ | Входной файл (input.txt ) |
Стандартный выход |
---|---|---|
1 |
|
|
2 |
|
|
3 |
|
|